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生物制药中的超级计算机
  • 2012-7-23 14:43:26
  • 类型:原创
  • 来源:电脑报
  • 报纸编辑:程朋
  • 作者:林特
【电脑报在线】7月19日,墨尔本圣文森特医药研究所的Michael Parker教授对外宣布,自己领导的一个课题小组正在利用超级计算机开发新型感冒药物。他表示有了超级计算机的帮助,他们可以更好地了解病毒的侵害过程。

超级计算机绘制的模型图

技术员正在维护超级计算机

 

    7月19日,墨尔本圣文森特医药研究所的Michael Parker教授对外宣布,自己领导的一个课题小组正在利用超级计算机开发新型感冒药物。他表示有了超级计算机的帮助,他们可以更好地了解病毒的侵害过程。

 

    医药教授的超级计算机助手

    目前,Biota的新药已经进入了测试阶段。在研发过程中使用的超级计算机是两台IBM Blue Gene。这两台超级计算机不仅仅只是可以用来观察病毒本身及其它们复制、传播的过程,同时它也可以用于研究量子物理、金融市场的表现和气象建模。

 

    约翰·瓦格纳博士是IBM生命科学协同研究室主任,他说这台超级计算机是目前南半球最快的计算机,在全世界排名第31,它的计算速度是每秒836兆亿次,它还是世界上最节能的计算机。

 

    在今天的医药尤其是生物制药行业,越来越多的公司和研究小组意识到超级计算机的重要性,纷纷利用超级计算机模拟出病毒体的活动线路,以此选择最佳的治疗方案,甚至形成了一门独特的学科:计算药物开发(Computational drug discovery)。

 

    美国得克萨斯大学奥斯汀分校计算机科学教授、国家卫生研究院研究小组主席钱德拉吉特·巴加伊是这个领域的权威,早在上世纪80年代,他就在实验室里利用IBM和惠普公司的超级计算机 进行课题开发,取得了很大的成果。

 

    巴加伊认为,对于药物审核越来越严格和对成本转移的速度越来越快,是超级计算机进入制药领域的关键。在最近十年,全美各大制药公司投在药物开发阶段的成本和时间正在向市场开发阶段转移,每10亿美元的成本投入获得美国食品和药物管理局(FDA)药物批准的机会也越来越少,这表明人们需要更快、更廉价的方法。

 

    超级计算机的高效率

    要知道开发新药跟开发任何一种生活用品完全不同,它所耗费的时间和精力不亚于登月工程。举个例子,现在要开发一种治疗支气管炎的新药。那么,第一步就必须分析引起支气管炎的病毒、细菌或导致疾病的基因变异,这些病原体有什么特点,会有什么变异。

 

本文出自2012-07-23出版的《电脑报》第29期 A.新闻评论
(网站编辑:李亚)


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